More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2009 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  50.89 
 
 
123 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
122 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  53.54 
 
 
115 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
117 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  46.02 
 
 
169 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 
124 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
117 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 
110 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  50.51 
 
 
112 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  48.21 
 
 
185 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
144 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  47.66 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  46.3 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  50 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  46.73 
 
 
117 aa  95.9  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.73 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 
115 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  45.37 
 
 
120 aa  94.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  47.47 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 
111 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  45.37 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
118 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
131 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  42.45 
 
 
112 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  46 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  46.74 
 
 
120 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
118 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  46.6 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  40 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 
110 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
104 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  40 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40.95 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.09 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  46.24 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  47.56 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>