More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4277 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  68.22 
 
 		 108 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 106 aa  155  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  65.69 
 
 		 105 aa  149  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 		 106 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  62.24 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  54 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  48 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  50.49 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  38.04 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  38.54 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  39.58 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  39.58 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.98 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  29 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  31.31 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 116 aa  66.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>