More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4878 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 109 aa  203  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 193 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  58.82 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  53.57 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  64.95 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  54.13 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  51.04 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  55.43 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  45.63 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  50.89 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  53.19 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  51.09 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.64 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  51.65 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  36.08 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  49.04 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  51.65 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  34 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  40.86 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  53.85 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  50.51 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  49.47 
 
 		 119 aa  84.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  42.48 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  35.35 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  49.44 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  47.78 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  46.32 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  48.89 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>