More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5491 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 99 aa  199  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  62.89 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  60.42 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  54.74 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 197 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.67 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  50.63 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  48.39 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.58 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  40.54 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>