More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1063 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 102 aa  199  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  51.04 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  48.96 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  45.36 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  38.78 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  38.54 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.38 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  29.29 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  33.68 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.45 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>