More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3344 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  89.66 
 
 
230 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  55.26 
 
 
99 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
117 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 
105 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
114 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  48.75 
 
 
109 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  53.33 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 
117 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
103 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  53.25 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.25 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
113 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
106 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
121 aa  73.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
124 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.22 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  48.19 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  47.5 
 
 
107 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
105 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  49.38 
 
 
109 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
104 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
86 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43.02 
 
 
121 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
126 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
107 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  38.1 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.47 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
115 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
117 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
90 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
123 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.23 
 
 
120 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
90 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
90 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
100 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
115 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
90 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
90 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
112 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.82 
 
 
268 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  43.21 
 
 
156 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 
133 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
107 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
89 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
107 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  38.75 
 
 
107 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  37.97 
 
 
107 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
106 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
103 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
110 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  47.62 
 
 
113 aa  62.4  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
107 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
107 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
107 aa  61.6  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
107 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
107 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
268 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>