More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3678 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  79.07 
 
 		 86 aa  149  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  81.18 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  81.18 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  48.84 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  48.31 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  45 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 437 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.5 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 330 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>