More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2326 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  79.34 
 
 
120 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  78.85 
 
 
111 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  75.7 
 
 
118 aa  163  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  77.32 
 
 
118 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  71.03 
 
 
113 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  77.36 
 
 
139 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  58.04 
 
 
137 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  58.1 
 
 
115 aa  114  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  52.38 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  55.96 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  55 
 
 
112 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  48.28 
 
 
185 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
131 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 
133 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  52.46 
 
 
124 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
114 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  52.34 
 
 
121 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  50.93 
 
 
112 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 
110 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  50 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  50 
 
 
113 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.22 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  43.69 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  48.04 
 
 
121 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
114 aa  84.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  42.06 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  45.87 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.36 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  38.74 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  41.51 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  41.51 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  40.57 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  31 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  30.28 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  41.49 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.38 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.27 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>