More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2988 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 106 aa  206  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  55.43 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  56.99 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  47.57 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  49.45 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43.33 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  43.69 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 193 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.7 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 94 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 197 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>