More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2507 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 120 aa  236  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  51.19 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.91 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.51 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.42 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  33.96 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  32.08 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>