More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1174 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  216  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  49.49 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  52.63 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  48.51 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  52.58 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.89 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  43.43 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  38.61 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  42.34 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.86 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  41.51 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  43.88 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>