More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0303 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
94 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 
93 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  67.47 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  63.95 
 
 
87 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  52.33 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  52.5 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  51.25 
 
 
96 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 
89 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  45.57 
 
 
97 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  56.45 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  47.95 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  40 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  32.53 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  34.12 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  34.94 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 
120 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  35.53 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  35 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  30.23 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  33.75 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  32.53 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>