More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5809 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 114 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  56.31 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.31 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  31.07 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  34.12 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.42 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  34.02 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  30.28 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  33.65 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  31.07 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  31.63 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  24.49 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  26.67 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>