More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2387 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.43 
 
 		 116 aa  129  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  59.8 
 
 		 330 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  54 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  51.46 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  51.89 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 120 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  51.92 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  51.96 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  51.79 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  50.93 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  48.51 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  48.54 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  47.87 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.53 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  44.55 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 115 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  40.95 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  48.39 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.12 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  42.48 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  43.69 
 
 		 185 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  44.04 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  42.45 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  49.37 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  41 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.19 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>