More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2213 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  76.32 
 
 		 115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.5 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  53.64 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  40.57 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.82 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  39.81 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  37.27 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  37.96 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  36.27 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  30.19 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  38.68 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  37.38 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.89 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>