More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1041 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  223  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  67.57 
 
 		 111 aa  153  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  62.39 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  52.08 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  46.81 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  46.23 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.34 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  40.18 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 330 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  42.99 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  44.34 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  41.96 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  43.62 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  38.18 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  43.33 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  37 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  38 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  54.55 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  41.12 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>