More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0357 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  227  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  85.19 
 
 		 109 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  78.76 
 
 		 120 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  78.76 
 
 		 117 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  78.38 
 
 		 117 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  76.47 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  49.5 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  48.45 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.3 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  46.08 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 110 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 113 aa  84.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  41 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  41 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  39.8 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43.9 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  49.4 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  33.96 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  32.67 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>