More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6352 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  68.07 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  67.68 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  65.35 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  64.49 
 
 		 111 aa  139  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  59.29 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  60.58 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  60.91 
 
 		 185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  59.62 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.82 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  57.41 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  53.57 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  51.92 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  51.33 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  46.09 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  50.49 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  49.14 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 118 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  51.02 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  48.51 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.11 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  45.28 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  44.34 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  43.81 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  36.56 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  43.12 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  42.72 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>