More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3232 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 113 aa  230  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  49.48 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  46.02 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  50.53 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  43 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  44.76 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  43.81 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43.75 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  43.81 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 330 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.16 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  39.22 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.76 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  41.49 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  40.43 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>