297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0479 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 114 aa  222  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  60.55 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  57.84 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.29 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  60 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  57.94 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  59.6 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  58.72 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  56.31 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.25 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30170  transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.758763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.28 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.81 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.21 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  52.17 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 330 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  28.72 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  47.22 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  37.74 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  27.72 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>