More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0987 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 267 aa  184  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  48.91 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  51.19 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  49.41 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.34 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  46.34 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  42.34 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  45.56 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.43 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  42.16 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 330 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  47.67 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  46.48 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  41.57 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 		 118 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  40.23 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  45.07 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45.45 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  54.9 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>