298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3553 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
110 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  84.55 
 
 
110 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  66.06 
 
 
124 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  67.27 
 
 
110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  63.37 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.05 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  59.18 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
108 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
108 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  54.63 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  56.7 
 
 
121 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30170  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.758763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  40 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 
330 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.81 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  39.8 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.6 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  40 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  28.12 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  39.77 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  36.79 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  32.32 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>