More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5219 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  236  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  76.32 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  75.22 
 
 		 120 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  77.39 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  75.73 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  70.1 
 
 		 113 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  51.75 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  55.05 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  46.09 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  49.49 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  46.79 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  54.35 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  53.54 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  46.9 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  46.3 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 137 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 118 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  42.34 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.74 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 330 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.78 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  31.73 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  36.89 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40.2 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  43.43 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 267 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.76 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  36.45 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  34.58 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>