More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3122 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  51.82 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  55.66 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  49.04 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  48.54 
 
 		 105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  45.79 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  48.11 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  39.22 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.98 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  30.1 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  31.73 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  36.56 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  30.1 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  30.39 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  31.31 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  28.87 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>