More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4142 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 114 aa  230  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  48.57 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 		 116 aa  103  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  48.18 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  46.73 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  51 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 330 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  47.62 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.82 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  48.08 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  47.87 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  39 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  38.74 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  37.96 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  41.35 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  32 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  37.61 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  26.21 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  26.21 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>