More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0955 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  233  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  50.48 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  46.73 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  48.54 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  46 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 330 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  45.28 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45.92 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  46.81 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 112 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  33.94 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.35 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  32.73 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  37.38 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.19 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  26.67 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  34 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>