More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4181 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  81.65 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  72.64 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  70.91 
 
 		 133 aa  164  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  69.23 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  66.99 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  67.68 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  64.15 
 
 		 111 aa  140  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  66.02 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  64.36 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 131 aa  136  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  62.86 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  63.37 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  63.11 
 
 		 110 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  58.25 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 114 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  55.24 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  55.45 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  53.64 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  55.67 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  49.55 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  49.49 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  50.51 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  48 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 116 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.45 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  51.4 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  46.46 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  40.95 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 330 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 122 aa  87  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  45.19 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.31 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>