More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0788 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 124 aa  247  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  72.57 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  65.74 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  59.18 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  55.24 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  53.7 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  53.04 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  57.43 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  55.66 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  53 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  46.36 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  54.08 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  52.78 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  51.4 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  50.91 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  44.86 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.09 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  46.3 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 267 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  31.13 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  32.67 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  35.78 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.14 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  31.68 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  34 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 330 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  30.28 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  32.71 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>