More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1204 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  85.84 
 
 		 113 aa  196  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  81.42 
 
 		 113 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  75.68 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  59.82 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  59.26 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  52.21 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  53.26 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.31 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  42 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.27 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  39.45 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  40.19 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.27 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 197 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  36.04 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  32.38 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  38.26 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.39 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  31.31 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  39.77 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  29.63 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>