More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3075 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  239  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  72.64 
 
 
112 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  69.81 
 
 
115 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  65.77 
 
 
115 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  69.16 
 
 
133 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 
119 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  65.35 
 
 
120 aa  141  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  61.47 
 
 
111 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  62.96 
 
 
112 aa  140  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  62.5 
 
 
185 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  62.5 
 
 
113 aa  135  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  62.14 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  56.6 
 
 
122 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  60 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.66 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  61 
 
 
131 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  55.45 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  57 
 
 
121 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
114 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
124 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  51.4 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  54.46 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  51.96 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 
140 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  55.45 
 
 
137 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  54.08 
 
 
111 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  56.04 
 
 
118 aa  103  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
146 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  46.02 
 
 
113 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
115 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  44.76 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  47.42 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  45.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.99 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
169 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  43.36 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
330 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  43.27 
 
 
113 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
115 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 
118 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  48.62 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  42.34 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.78 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
117 aa  84.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 
113 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
99 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  39.42 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  42.16 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.51 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>