More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1615 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  88.07 
 
 		 113 aa  194  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  83.78 
 
 		 112 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2568  ArsR family transcriptional regulator  84.06 
 
 		 70 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.211094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.21 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 330 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  49.55 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  52.83 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  55.77 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  51.79 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  48.65 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  53 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  49 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  45.28 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  42.16 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  47.66 
 
 		 121 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  43.56 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.98 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  38.68 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  40.37 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  43.02 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  43.88 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  43.02 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>