More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0562 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  236  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
124 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  100  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.83 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.79 
 
 
121 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
117 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37.96 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.43 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
105 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  35.78 
 
 
119 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  35.24 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.4 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  39.18 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  40.82 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  35.92 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
115 aa  76.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  34.34 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.41 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  34.51 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.14 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  36.7 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.91 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  31.48 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  31.48 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.36 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  29.91 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  32.32 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
330 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>