More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2302 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  95.33 
 
 
107 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  88.79 
 
 
107 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  87.85 
 
 
107 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  191  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
111 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  82.24 
 
 
107 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  82.24 
 
 
107 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  183  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  79.41 
 
 
108 aa  180  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 
107 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  68.93 
 
 
106 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
103 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  52.48 
 
 
109 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
104 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  43 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
104 aa  83.6  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  40.38 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.07 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.96 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  32.38 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  39 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.96 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
117 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
108 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.58 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  40.82 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  34 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 
330 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  39.29 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>