More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2792 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 103 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  79.61 
 
 		 104 aa  170  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  74.76 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  73.79 
 
 		 104 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  75.49 
 
 		 104 aa  157  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  73.79 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  73.47 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 104 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  42.72 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  42.57 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.19 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 330 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.73 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.35 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  41.11 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  27.66 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  38.83 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 105 aa  67  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>