More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4502 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 107 aa  219  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  87.85 
 
 		 107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  87.85 
 
 		 107 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  86.92 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  81.31 
 
 		 107 aa  190  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 		 111 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  80.37 
 
 		 107 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  80.37 
 
 		 107 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  80.37 
 
 		 107 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  75 
 
 		 108 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 		 107 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 107 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 107 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 		 106 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 103 aa  103  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  50.49 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  40.57 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  43.82 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  30.53 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  33.65 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.48 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  28.42 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  40.54 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  34 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  30.21 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>