More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4442 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  220  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  220  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  220  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  95.33 
 
 
111 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  92.52 
 
 
107 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  90.65 
 
 
107 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  88.79 
 
 
107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  86.92 
 
 
107 aa  186  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  83.18 
 
 
107 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  82.24 
 
 
107 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  83.18 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  80.37 
 
 
107 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  73.58 
 
 
108 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 
107 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 
106 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  53.47 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  47.57 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 
104 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 
104 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.86 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.78 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  40 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.91 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30.93 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  41.76 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  41.76 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
330 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>