More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22370 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  58.24 
 
 
109 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
105 aa  103  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
129 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
104 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
141 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  55.79 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  51.61 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
193 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  46.85 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
107 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  48.08 
 
 
119 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 
112 aa  84.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
105 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  47.25 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  41.3 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  46.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  39.42 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  41 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
104 aa  76.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  35.65 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  41.23 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  46.15 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.37 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
197 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  44.04 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>