More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1533 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
104 aa  212  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
104 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  59.26 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  59.62 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 
104 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  59.62 
 
 
104 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  59.22 
 
 
103 aa  133  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  57.69 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
107 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
107 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 
107 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
107 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 
107 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
107 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 
107 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  50.51 
 
 
109 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
107 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 
107 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  47 
 
 
107 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 
107 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
111 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.56 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  47.52 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  44.57 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.9 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  43.43 
 
 
114 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
121 aa  76.6  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  47.19 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>