More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4032 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.81 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  65.45 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 111 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  63.44 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  57.94 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  57.73 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  53 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  52.87 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  42.73 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  41.28 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  43.62 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.11 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.37 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  37.96 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  29.52 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  32.63 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  39.08 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 197 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>