More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3489 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  220  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  79.44 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  75.7 
 
 		 107 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  74.77 
 
 		 107 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 111 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  75.7 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  73.83 
 
 		 107 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 107 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  61.76 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  56.57 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  53.33 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  49 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  47 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  42.72 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.67 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.16 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.42 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.96 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.55 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  37.37 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  33.68 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>