More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2050 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  215  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  82.69 
 
 		 104 aa  175  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  79.81 
 
 		 104 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  80.2 
 
 		 108 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  79.81 
 
 		 104 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  78.85 
 
 		 104 aa  170  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  79.61 
 
 		 103 aa  170  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 104 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  40.59 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.84 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.07 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  39 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  32.35 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 193 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  38.95 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.39 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  30.21 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27.84 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  32.67 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>