More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2881 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 118 aa  234  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  79.41 
 
 		 109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  75.89 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 120 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  81.37 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  83.67 
 
 		 117 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  76.47 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  52.04 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45.45 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 330 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  45.36 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  44.33 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  46.25 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  44.32 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  37.38 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  37.14 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43.68 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  37.39 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  42.59 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 267 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>