More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2227 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  70.71 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  70.71 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1062  transcriptional regulator, ArsR family  60.4 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  52.31 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.95 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  38.27 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 437 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 309 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  41.03 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  43.06 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  32.56 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>