More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3504 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 119 aa  231  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  66.04 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  70.59 
 
 		 133 aa  146  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  63.72 
 
 		 115 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  66.99 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 111 aa  129  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  64.15 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  63.64 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  57.02 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  59.8 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  63.92 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  59.79 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  56.19 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  55.56 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  57.45 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  48.48 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  49.5 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  47.12 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  56.12 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  50.94 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  49.5 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  46.9 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  50.51 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  58 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  47.17 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 330 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  48.45 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  50.53 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  47.47 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 123 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 109 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  48.08 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  46.39 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  44.79 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>