More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2109 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  266  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  83.08 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  63.33 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  65.38 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  61.11 
 
 		 112 aa  136  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  61.32 
 
 		 112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  56.78 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  62.38 
 
 		 185 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  61 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  66.67 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  56.07 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  56.64 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  54.05 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  54.72 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  46.02 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  51.46 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  54.37 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.96 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  53.04 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  52.21 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  43.43 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  37.62 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 		 330 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  36.94 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  39.62 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.78 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  41.9 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  51.65 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 267 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  36.79 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0987  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>