More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1718 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 110 aa  230  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  41.05 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  34.34 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  34.34 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  35.24 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.3 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 		 330 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 185 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.71 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  36.54 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  36.27 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  33.98 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  31 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.83 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  31.31 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>