More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1014 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  62.62 
 
 		 113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  61.82 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  58.88 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  60.38 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  59.63 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.81 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  57.01 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  58.25 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  55.08 
 
 		 185 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  58.33 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  54.24 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  57.14 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  53.7 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  51.96 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  51.85 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  51.02 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  46.36 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  52.34 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  46 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  48.96 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  45.05 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  52.27 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  48.51 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 115 aa  87.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  52.27 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  40.95 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  45 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  40.37 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  44.66 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  52.94 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.66 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 330 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  38.32 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>