More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1233 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  57.69 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  48.42 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  48.35 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  38 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40.2 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.33 
 
 		 240 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 169 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  48.28 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  38.61 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  41.9 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  37.76 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  43.43 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  35.64 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>