More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1468 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 132 aa  277  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  62 
 
 		 104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  59.6 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  52.08 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  52.38 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  41.9 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  39.62 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  39.05 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  41.3 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.86 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  36.27 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37.07 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  31.62 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  33.65 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  35.05 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  35.45 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.38 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  30.1 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  31.37 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>