More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2829 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
108 aa  224  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  74.77 
 
 
107 aa  179  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  74.77 
 
 
107 aa  178  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  78.64 
 
 
107 aa  176  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  74.76 
 
 
111 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  70.09 
 
 
107 aa  168  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
106 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  56.19 
 
 
105 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  54.72 
 
 
108 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
106 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  54 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  48.11 
 
 
113 aa  103  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  49.02 
 
 
104 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 
120 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 
106 aa  100  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  31.37 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  32.32 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  29 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  28 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
105 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  29 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  34 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  27.45 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  28.28 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  26.73 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
437 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  29.47 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.57 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  35.37 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
197 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  25.25 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>